La Gouvernance de la Fondation est assurée par un Bureau et un Conseil d’administration.
Désigné par le Conseil d’administration, le bureau constitue l’organe exécutif de la Fondation et comprend quatre membres dont le Président du Conseil d’administration.
Général d’armée Benoît PUGA
Grand chancelier de la Légion d’honneur et chancelier de l’ordre national du Mérite. Président de la Fondation Un Avenir Ensemble.
Bernard ESAMBERT
Vice-président de la Fédération pour la Recherche sur le Cerveau.
Le Conseil d’administration est constitué de trois collèges : le collège des fondateurs, le collège des membres de droit, et le collège des personnes qualifiées.